Sice PC nejsou moje silná stránka, ale co se týče spouštění programů po startu systému, doporučuju zkontrolovat složku "Po spuštění" (Start -> Programy -> Po spuštění) + Start -> Spustit, zadat "msconfig" (bez uvozovek) -> záložka "Po spuštění".
Jinak Windows taky potřebují určitou péči, tj. občas je "projet" antivirem (doporučuju NOD32 od Esetu), promazat cookies, cache a taky je poměrně důležitý jednou za čas vyčistit registry (systém se zrychlí, ale taky proč tam mít bordel, že). Koukněte sem a určitě si něco vyberete:
www.stahuj.cz/utility_a_o
statni/.../optimalizace_sy
stemu (já osobně nejčastěji používám CM DiskCleaner

)